КХО состоит из преамбулы, 24 статей и трех приложений - Приложения по химикатам, Приложения по проверке и Приложения по конфиденциальности.

Смысл принятия Конвенции о химическом оружии в наиболее сжатом виде отражен в преамбуле, где говорится: "…будучи преисполнены решимости в интересах всего человечества полностью исключить возможность применения химического оружия посредством осуществления положений настоящей Конвенции". Далее в преамбуле говорится о пользе мирной химии и желании поощрять свободную торговлю химикатами, а также международное сотрудничество в области химической деятельности, не запрещаемой по Конвенции.

В статье I излагаются общие обязательства каждого государства-участника по Конвенции. Конвенция запрещает государству-участнику применять химическое оружие или проводить военные приготовления к применению химического оружия. Кроме того, государство-участник никогда не должно "разрабатывать, производить, приобретать иным образом, накапливать или сохранять химическое оружие или передавать прямо или косвенно химическое оружие кому бы то ни было". Аналогичным образом, государство-участник не может содействовать или оказывать помощь какой-либо деятельности, осуществляемой отдельными лицами, группами или другим государством и запрещаемой по Конвенции. Согласно статье I, государство-участник должно уничтожить все запасы химического оружия, которые находятся в его владении, а также все объекты по производству химического оружия (ОПХО) на своей территории и любое химическое оружие, которое оно могло оставить на территории другого государства-участника. Кроме того, согласно статье I, химические средства борьбы с беспорядками (например, слезоточивый газ) запрещается использовать в качестве средства ведения войны.

В статье II КХО содержатся определения и критерии, подлежащие использованию в ходе осуществления Конвенции. Среди прочего, приводятся определения таких терминов, как "химическое оружие", "токсичный химикат", "прекурсор", "старое химическое оружие", "оставленное химическое оружие", "химические средства борьбы с беспорядками", "объект по производству химического оружия" и другие термины, имеющие отношение к режиму проверки промышленности: "производственная мощность", "переработка", "потребление" и т.д.

В статье III содержится требование о представлении объявлений в ОЗХО каждым государством-участником не позднее чем через 30 дней после того, как Конвенция вступает в силу для этого конкретного государства-участника. Государство-участник должно объявить, владеет ли оно химическим оружием и/или ОПХО, а также свои планы их уничтожения. Кроме того, оно должно объявить любые другие объекты, предназначенные для разработки химического оружия, такие как лаборатории, и владение или невладение химическими средствами борьбы с беспорядками. В этих объявлениях также содержится подробная информация о наличии или отсутствии у государства-участника старого химического оружия на его территории и факт оставления химического оружия на территории другого государства-участника или наличия на его территории такого оружия, оставленного другим государством-участником. Химическое оружие, которое было захоронено после 1977 года или сброшено в море, после 1 января 1985 года также подлежит объявлению.

Статьи IV и V касаются требования об уничтожении государствами-участниками своего химического оружия и ОПХО, включая представление подробных планов уничтожения и ежегодных объявлений о ходе операций по уничтожению. В случае ОПХО государства-участники могут запросить их конверсию на использование в мирных, незапрещаемых целях. Ответственность за покрытие расходов по уничтожению и/или конверсии и расходов по проверке деятельности по уничтожению, проводимой ОЗХО, лежит на самих государствах-участниках. Предполагается, что деятельность по уничтожению и/или конверсии будет завершена в течение десяти лет после вступления в силу Конвенции. В Конвенции предусмотрена возможность одноразового продления окончательного срока уничтожения химического оружия на период до 5 лет - 2012 года.

Статья VI касается "деятельности, не запрещаемой по настоящей Конвенции", т.е. деятельности, известной как режим нераспространения или режим проверки промышленности. Государства-участники должны обеспечить, чтобы токсичные химикаты и их прекурсоры разрабатывались, производились, передавались и использовались исключительно в мирных целях. Объекты, производящие списочные химикаты и конкретные органические химикаты, подпадают под механизмы контроля и отчетности, осуществляемые государством-участником, и инспекции, проводимые ОЗХО.

Статья VII касается национальных мер по осуществлению Конвенции и содержит требование о том, чтобы каждое государство-участник приняло на национальном уровне законодательство об осуществлении, предусматривающее уголовное наказание в контексте национального уголовного права за нарушение содержащихся в Конвенции запретов, и информировало ОЗХО о мерах, принятых для осуществления Конвенции. Согласно этой статье государства-участники обязуются сотрудничать в области правовой помощи, безопасности и окружающей среды. Эта статья требует также учреждения Национального органа для поддержания связей между государством-участником и ОЗХО.

Согласно статье VIII учреждается Организация по запрещению химического оружия, или ОЗХО, в качестве осуществляющего Конвенцию органа со штаб-квартирой в Гааге, Нидерланды. Организация состоит из трех главных органов: Конференции государств-участников, Исполнительного совета и Технического секретариата. В статье VIII определяются роль и функции каждого органа (см. схему).

В статье IX предусматриваются процедуры проведения консультаций и разъяснений в случае возникновения обеспокоенностей относительно возможного несоблюдения Конвенции. Кроме того, там содержатся процедуры представления запроса и проведения инспекций по запросу в любом государстве-участнике, если имеются сомнения относительно соблюдения им Конвенции. Любое государство-участник может запросить инспекцию по запросу в любом месте на территории другого государства-участника.

Статьи Х и XI касаются, соответственно, помощи и защиты, предоставляемых государству-участнику в случае нападения или угрозы нападения с применением химического оружия, а также международного сотрудничества в области экономического и технического развития государств-участников. Согласно статье Х, каждое государство-участник должно информировать ОЗХО о виде(ах) поддержки, которую оно может оказывать усилиям в области помощи и защиты. Статья XI предусматривает содействие торговле химикатами в мирных целях и развитие химии во всех государствах-участниках в целях, не запрещаемых по Конвенции.

Статья XII касается мер по обеспечению соблюдения, включая санкции в отношении государства-участника, не соблюдающего свои обязательства по Конвенции. Помимо принятия мер по исправлению положения, санкций или ограничения прав и привилегий и т.д., в особо серьезных случаях Конференция доводит данную проблему до сведения Генеральной Ассамблеи Организации Объединенных Наций и Совета Безопасности.

Статьи XIII-XXIV касаются различных вопросов, таких как взаимосвязь с другими международными соглашениями, урегулирование споров, внесение поправок в Конвенцию, срок действия Конвенции и выход из нее, вступление в силу и т.д.

Из трех приложений наиболее обширным является Приложение по проверке. В нем излагаются все подробные процедуры, которые должны использоваться государствами-участниками и инспекционными группами ОЗХО при проведении деятельности по проверке/инспекционной деятельности на объектах или в местах химического оружия и на промышленных объектах. Приложение по химикатам определяет три списка, которые упоминались ранее (см. врезку), а в Приложении по конфиденциальности содержатся гарантии защиты чувствительной, связанной с национальной безопасностью информации и конфиденциальной коммерческой информации в ходе инспекций, а также при представлении такой информации государствами-участниками в ОЗХО.